Generazione di una nova firma basata nantu à LncRNA correlata à u sistema immunitariu per identificà i pazienti cun adenocarcinoma pancreaticu à altu è bassu risicu | BMC Gastroenterology

U cancru di u pancreas hè unu di i tumori più mortali in u mondu cù una prognosi sfavurevule. Dunque, hè necessariu un mudellu di predizione precisu per identificà i pazienti à altu risicu di cancru di u pancreas per adattà u trattamentu è migliurà a prognosi di sti pazienti.
Avemu ottenutu dati RNAseq di l'adenocarcinoma pancreaticu (PAAD) di The Cancer Genome Atlas (TCGA) da a basa di dati UCSC Xena, avemu identificatu lncRNA immuno-correlati (irlncRNA) per mezu di l'analisi di currelazione è avemu identificatu e differenze trà i tessuti TCGA è l'adenocarcinoma pancreaticu nurmale. DEirlncRNA) da TCGA è l'espressione tissutale genotipizzata (GTEx) di u tissutu pancreaticu. Ulteriori analisi di regressione univariata è lasso sò state realizate per custruisce mudelli di firma prognostica. Avemu dopu calculatu l'area sottu à a curva è determinatu u valore di cutoff ottimale per identificà i pazienti cun adenocarcinoma pancreaticu à altu è bassu risicu. Per paragunà e caratteristiche cliniche, l'infiltrazione di e cellule immunitarie, u microambiente immunosoppressivu è a resistenza à a chemioterapia in pazienti cun cancru pancreaticu à altu è bassu risicu.
Avemu identificatu 20 coppie di DEirlncRNA è raggruppatu i pazienti secondu u valore di cutoff ottimale. Avemu dimustratu chì u nostru mudellu di firma prognostica hà una prestazione significativa in a previsione di a prognosi di i pazienti cun PAAD. L'AUC di a curva ROC hè 0,905 per a previsione à 1 annu, 0,942 per a previsione à 2 anni è 0,966 per a previsione à 3 anni. I pazienti à altu risicu avianu tassi di sopravvivenza più bassi è caratteristiche cliniche peghju. Avemu ancu dimustratu chì i pazienti à altu risicu sò immunosoppressi è ponu sviluppà resistenza à l'immunoterapia. A valutazione di farmaci antitumorali cum'è paclitaxel, sorafenib è erlotinib basata annantu à strumenti di previsione computazionale pò esse adatta per i pazienti à altu risicu cun PAAD.
In generale, u nostru studiu hà stabilitu un novu mudellu di risicu prognosticu basatu annantu à l'irlncRNA accoppiatu, chì hà dimustratu un valore prognosticu promettente in i pazienti cun cancru di u pancreas. U nostru mudellu di risicu prognosticu pò aiutà à diferenzià i pazienti cun PAAD chì sò adatti per u trattamentu medicu.
U cancru di u pancreas hè un tumore malignu cù un bassu tassu di sopravvivenza à cinque anni è un gradu altu. À u mumentu di a diagnosi, a maiò parte di i pazienti sò digià in stadii avanzati. In u cuntestu di l'epidemia di COVID-19, i medichi è l'infermieri sò sottumessi à una pressione enorme quandu trattanu i pazienti cun cancru di u pancreas, è e famiglie di i pazienti affrontanu ancu parechje pressioni quandu piglianu decisioni di trattamentu [1, 2]. Ancu s'è sò stati fatti grandi progressi in u trattamentu di i DOAD, cum'è a terapia neoadjuvante, a resezione chirurgica, a radioterapia, a chemioterapia, a terapia moleculare mirata è l'inibitori di i checkpoint immunitari (ICI), solu circa u 9% di i pazienti sopravvivenu cinque anni dopu a diagnosi [3], 4]. Siccomu i primi sintomi di l'adenocarcinoma pancreaticu sò atipici, i pazienti sò generalmente diagnosticati cù metastasi in un stadiu avanzatu [5]. Dunque, per un paziente datu, un trattamentu cumpletu individualizatu deve valutà i vantaghji è i svantaghji di tutte l'opzioni di trattamentu, micca solu per prolongà a sopravvivenza, ma ancu per migliurà a qualità di vita [6]. Dunque, un mudellu di previsione efficace hè necessariu per valutà accuratamente a prognosi di un paziente [7]. Cusì, un trattamentu adattatu pò esse sceltu per equilibrà a sopravvivenza è a qualità di vita di i pazienti cun PAAD.
A mala prognosi di a PAAD hè principalmente duvuta à a resistenza à i medicinali chemioterapichi. In l'ultimi anni, l'inibitori di i punti di cuntrollu immunitari sò stati largamente aduprati in u trattamentu di i tumori solidi [8]. Tuttavia, l'usu di l'ICI in u cancru di u pancreas hè raramente riesciutu [9]. Dunque, hè impurtante identificà i pazienti chì puderanu prufittà di a terapia ICI.
L'ARN longu non codificante (lncRNA) hè un tipu d'ARN non codificante cù trascritti >200 nucleotidi. I LncRNA sò diffusi è custituiscenu circa l'80% di u trascrittoma umanu [10]. Un grande corpus di travagli hà dimustratu chì i mudelli prognostici basati nantu à lncRNA ponu prevede efficacemente a prognosi di i pazienti [11, 12]. Per esempiu, 18 lncRNA ligati à l'autofagia sò stati identificati per generà firme prognostiche in u cancru di u senu [13]. Altri sei lncRNA ligati à u sistema immunitariu sò stati aduprati per stabilisce e caratteristiche prognostiche di u glioma [14].
In u cancru di u pancreas, certi studii anu stabilitu firme basate nantu à lncRNA per predisce a prognosi di i pazienti. Una firma 3-lncRNA hè stata stabilita in l'adenocarcinoma pancreaticu cù una area sottu à a curva ROC (AUC) di solu 0,742 è una sopravvivenza generale (OS) di 3 anni [15]. Inoltre, i valori di espressione di lncRNA varianu trà diversi genomi, diversi furmati di dati è diversi pazienti, è a prestazione di u mudellu predittivu hè instabile. Dunque, usemu un novu algoritmu di modelizazione, accoppiamentu è iterazione, per generà firme lncRNA (irlncRNA) relative à l'immunità per creà un mudellu predittivu più precisu è stabile [8].
I dati RNAseq nurmalizzati (FPKM) è i dati TCGA di u cancru pancreaticu clinicu è di l'espressione tissutale di u genotipu (GTEx) sò stati ottenuti da a basa di dati UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/). I fugliali GTF sò stati ottenuti da a basa di dati Ensembl (http://asia.ensembl.org) è sò stati utilizati per estrae profili d'espressione di lncRNA da RNAseq. Avemu scaricatu geni ligati à l'immunità da a basa di dati ImmPort (http://www.immport.org) è identificatu lncRNA ligati à l'immunità (irlncRNA) utilizendu l'analisi di currelazione (p <0,001, r > 0,4). Identificazione di irlncRNA espressi in modu differenziale (DEirlncRNA) incruciendu irlncRNA è lncRNA espressi in modu differenziale ottenuti da a basa di dati GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) in a coorte TCGA-PAAD (|logFC| > 1 è FDR) <0,05).
Stu metudu hè statu digià signalatu [8]. Specificamente, custruemu X per rimpiazzà l'lncRNA A è lncRNA B accoppiati. Quandu u valore d'espressione di lncRNA A hè più altu ch'è u valore d'espressione di lncRNA B, X hè definitu cum'è 1, altrimenti X hè definitu cum'è 0. Dunque, pudemu ottene una matrice di 0 o – 1. L'asse verticale di a matrice rapprisenta ogni campione, è l'asse orizzontale rapprisenta ogni coppia DEirlncRNA cù un valore di 0 o 1.
L'analisi di regressione univariata seguita da a regressione Lasso hè stata aduprata per screening e coppie di DEirlncRNA prognostiche. L'analisi di regressione lasso hà utilizatu una validazione incrociata di 10 volte ripetuta 1000 volte (p < 0,05), cù 1000 stimuli aleatorii per corsa. Quandu a frequenza di ogni coppia di DEirlncRNA hà superatu 100 volte in 1000 cicli, e coppie di DEirlncRNA sò state selezziunate per custruisce un mudellu di risicu prognosticu. Avemu dopu utilizatu a curva AUC per truvà u valore di cutoff ottimale per classificà i pazienti PAAD in gruppi à risicu altu è bassu. U valore AUC di ogni mudellu hè statu ancu calculatu è tracciatu cum'è una curva. Se a curva righjunghji u puntu più altu chì indica u valore AUC massimu, u prucessu di calculu si ferma è u mudellu hè cunsideratu u megliu candidatu. Sò stati custruiti mudelli di curva ROC di 1, 3 è 5 anni. L'analisi di regressione univariata è multivariata sò state aduprate per esaminà a prestazione predittiva indipendente di u mudellu di risicu prognosticu.
Aduprate sette strumenti per studià i tassi d'infiltrazione di e cellule immune, cumpresi XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, è CIBERSORT. I dati d'infiltrazione di e cellule immune sò stati scaricati da a basa di dati TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). A differenza in u cuntenutu di e cellule immune-infiltranti trà i gruppi à risicu altu è bassu di u mudellu custruitu hè stata analizata aduprendu u test di Wilcoxon signed-rank, i risultati sò mostrati in u graficu quadratu. L'analisi di currelazione di Spearman hè stata realizata per analizà a relazione trà i valori di u puntuu di risicu è e cellule immune-infiltranti. U cuefficiente di currelazione risultante hè mostratu cum'è un lecca-lecca. A soglia di significatività hè stata fissata à p < 0,05. A prucedura hè stata realizata aduprendu u pacchettu R ggplot2. Per esaminà a relazione trà u mudellu è i livelli d'espressione genica assuciati à u tassu d'infiltrazione di e cellule immune, avemu realizatu u pacchettu ggstatsplot è a visualizazione di u graficu di violinu.
Per valutà i mudelli di trattamentu clinicu per u cancru di u pancreas, avemu calculatu l'IC50 di i medicinali chemioterapichi cumunimenti usati in a coorte TCGA-PAAD. E differenze in e concentrazioni inhibitorie di metà (IC50) trà i gruppi à risicu altu è bassu sò state paragunate aduprendu u test di Wilcoxon signed-rank, è i risultati sò mostrati cum'è boxplot generati aduprendu pRRophetic è ggplot2 in R. Tutti i metudi sò conformi à e linee guida è e norme pertinenti.
U flussu di travagliu di u nostru studiu hè mostratu in a Figura 1. Usendu l'analisi di currelazione trà l'lncRNA è i geni ligati à l'immunità, avemu sceltu 724 irlncRNA cù p < 0,01 è r > 0,4. Dopu avemu analizatu l'lncRNA espressi in modu differenziale di GEPIA2 (Figura 2A). Un totale di 223 irlncRNA sò stati espressi in modu differenziale trà l'adenocarcinoma pancreaticu è u tissutu pancreaticu nurmale (|logFC| > 1, FDR < 0,05), chjamati DEirlncRNA.
Custruzzione di mudelli di risicu predittivu. (A) Graficu di vulcanu di lncRNA espressi in modu differenziale. (B) Distribuzione di i coefficienti di lasso per 20 coppie di DEirlncRNA. (C) Varianza di probabilità parziale di a distribuzione di u coefficiente LASSO. (D) Graficu di furesta chì mostra l'analisi di regressione univariata di 20 coppie di DEirlncRNA.
Dopu avemu custruitu una matrice 0 o 1 assuciendu 223 DEirlncRNA. Un totale di 13.687 coppie di DEirlncRNA sò state identificate. Dopu à l'analisi di regressione univariata è lasso, 20 coppie di DEirlncRNA sò state infine testate per custruisce un mudellu di risicu prognosticu (Figura 2B-D). Basatu annantu à i risultati di Lasso è di l'analisi di regressione multipla, avemu calculatu un puntu di risicu per ogni paziente in a coorte TCGA-PAAD (Tabella 1). Basatu annantu à i risultati di l'analisi di regressione lasso, avemu calculatu un puntu di risicu per ogni paziente in a coorte TCGA-PAAD. L'AUC di a curva ROC era 0,905 per a predizione di u mudellu di risicu di 1 annu, 0,942 per a predizione di 2 anni è 0,966 per a predizione di 3 anni (Figura 3A-B). Avemu stabilitu un valore limite ottimale di 3,105, stratificatu i pazienti di a coorte TCGA-PAAD in gruppi à risicu altu è bassu, è tracciatu i risultati di sopravvivenza è e distribuzioni di i punteggi di risicu per ogni paziente (Figura 3C-E). L'analisi di Kaplan-Meier hà dimustratu chì a sopravvivenza di i pazienti PAAD in u gruppu à risicu altu era significativamente più bassa di quella di i pazienti in u gruppu à bassu risicu (p < 0,001) (Figura 3F).
Validità di i mudelli di risicu prognosticu. (A) ROC di u mudellu di risicu prognosticu. (B) Modelli di risicu prognosticu ROC di 1, 2 è 3 anni. (C) ROC di u mudellu di risicu prognosticu. Mostra u puntu di cutoff ottimale. (DE) Distribuzione di u statutu di sopravvivenza (D) è punteggi di risicu (E). (F) Analisi di Kaplan-Meier di i pazienti PAAD in gruppi à risicu altu è bassu.
Avemu ancu valutatu e differenze in i punteggi di risicu per caratteristiche cliniche. U graficu à strisce (Figura 4A) mostra a relazione generale trà e caratteristiche cliniche è i punteggi di risicu. In particulare, i pazienti anziani avianu punteggi di risicu più alti (Figura 4B). Inoltre, i pazienti cù u stadiu II avianu punteggi di risicu più alti cà i pazienti cù u stadiu I (Figura 4C). Riguardu à u gradu di u tumore in i pazienti PAAD, i pazienti di gradu 3 avianu punteggi di risicu più alti cà i pazienti di gradu 1 è 2 (Figura 4D). Avemu ancu realizatu analisi di regressione univariate è multivariate è avemu dimustratu chì u punteggio di risicu (p < 0,001) è l'età (p = 0,045) eranu fattori prognostici indipendenti in i pazienti cù PAAD (Figura 5A-B). A curva ROC hà dimustratu chì u punteggio di risicu era superiore à altre caratteristiche cliniche in a previsione di a sopravvivenza à 1, 2 è 3 anni di i pazienti cù PAAD (Figura 5C-E).
Caratteristiche cliniche di i mudelli di risicu prognosticu. L'istogramma (A) mostra (B) età, (C) stadiu di u tumore, (D) gradu di u tumore, puntu di risicu è sessu di i pazienti in a coorte TCGA-PAAD. **p < 0,01
Analisi predittiva indipendente di i mudelli di risicu prognosticu. (AB) Analisi di regressione univariata (A) è multivariata (B) di i mudelli di risicu prognosticu è di e caratteristiche cliniche. (CE) ROC di 1, 2 è 3 anni per i mudelli di risicu prognosticu è e caratteristiche cliniche.
Dunque, avemu esaminatu a relazione trà u tempu è i punteggi di risicu. Avemu trovu chì u punteggio di risicu in i pazienti PAAD era inversamente correlato cù e cellule T CD8+ è e cellule NK (Figura 6A), chì indica una funzione immune soppressa in u gruppu à altu risicu. Avemu ancu valutatu a differenza in l'infiltrazione di e cellule immunitarie trà i gruppi à altu è bassu risicu è avemu trovu i stessi risultati (Figura 7). Ci era menu infiltrazione di cellule T CD8+ è cellule NK in u gruppu à altu risicu. In l'ultimi anni, l'inibitori di i checkpoint immunitari (ICI) sò stati largamente aduprati in u trattamentu di i tumori solidi. Tuttavia, l'usu di ICI in u cancru di u pancreas hà raramente avutu successu. Dunque, avemu valutatu l'espressione di i geni di i checkpoint immunitari in i gruppi à altu è bassu risicu. Avemu trovu chì CTLA-4 è CD161 (KLRB1) eranu sovraespressi in u gruppu à bassu risicu (Figura 6B-G), chì indica chì i pazienti PAAD in u gruppu à bassu risicu ponu esse sensibili à ICI.
Analisi di currelazione di u mudellu di risicu prognosticu è l'infiltrazione di e cellule immunitarie. (A) Correlazione trà u mudellu di risicu prognosticu è l'infiltrazione di e cellule immunitarie. (BG) Indica l'espressione genica in gruppi à risicu altu è bassu. (HK) Valori IC50 per farmaci antitumorali specifici in gruppi à risicu altu è bassu. *p < 0,05, **p < 0,01, ns = micca significativu
Avemu ancu valutatu l'associazione trà i punteggi di risicu è l'agenti chemioterapichi cumuni in a coorte TCGA-PAAD. Avemu cercatu medicinali anticancerosi cumunimenti usati in u cancru di u pancreas è analizatu e differenze in i so valori IC50 trà i gruppi à risicu altu è bassu. I risultati anu dimustratu chì u valore IC50 di AZD.2281 (olaparib) era più altu in u gruppu à risicu altu, chì indica chì i pazienti PAAD in u gruppu à risicu altu ponu esse resistenti à u trattamentu AZD.2281 (Figura 6H). Inoltre, i valori IC50 di paclitaxel, sorafenib è erlotinib eranu più bassi in u gruppu à risicu altu (Figura 6I-K). Avemu ancu identificatu 34 medicinali anticancerosi cù valori IC50 più alti in u gruppu à risicu altu è 34 medicinali anticancerosi cù valori IC50 più bassi in u gruppu à risicu altu (Tabella 2).
Ùn si pò nigà chì l'lncRNA, l'mRNA è i miRNA esistenu largamente è ghjocanu un rolu cruciale in u sviluppu di u cancheru. Ci hè una grande evidenza chì sustene u rolu impurtante di l'mRNA o di u miRNA in a predizione di a sopravvivenza generale in parechji tipi di cancheru. Senza dubbitu, parechji mudelli di risicu prognosticu sò ancu basati nantu à lncRNA. Per esempiu, Luo et al. Studi anu dimustratu chì LINC01094 ghjoca un rolu chjave in a proliferazione è a metastasi di i PC, è l'alta espressione di LINC01094 indica una scarsa sopravvivenza di i pazienti cun cancheru di u pancreas [16]. U studiu presentatu da Lin et al. Studi anu dimustratu chì a downregulation di lncRNA FLVCR1-AS1 hè assuciata à una scarsa prognosi in i pazienti cun cancheru di u pancreas [17]. Tuttavia, l'lncRNA ligati à l'immunità sò relativamente menu discussi in termini di predizione di a sopravvivenza generale di i pazienti cun cancheru. Recentemente, una grande quantità di travagliu hè stata focalizzata nantu à a custruzione di mudelli di risicu prognosticu per predisce a sopravvivenza di i pazienti cun cancheru è cusì adattà i metudi di trattamentu [18, 19, 20]. Ci hè una crescente ricunniscenza di u rolu impurtante di l'infiltrati immunitari in l'iniziu, a progressione è a risposta di u cancheru à trattamenti cum'è a chemioterapia. Numerosi studii anu cunfirmatu chì e cellule immunitarie chì s'infiltranu in u tumore ghjocanu un rolu criticu in a risposta à a chemioterapia citotossica [21, 22, 23]. U microambiente immunitariu tumorale hè un fattore impurtante in a sopravvivenza di i pazienti cun tumore [24, 25]. L'immunoterapia, in particulare a terapia ICI, hè largamente aduprata in u trattamentu di tumori solidi [26]. I geni ligati à u sistema immunitariu sò largamente aduprati per custruisce mudelli di risicu prognosticu. Per esempiu, Su et al. U mudellu di risicu prognosticu ligatu à u sistema immunitariu hè basatu annantu à geni chì codificanu proteine ​​per predisce a prognosi di i pazienti cun cancheru ovarianu [27]. I geni non codificanti cum'è lncRNA sò ancu adatti per custruisce mudelli di risicu prognosticu [28, 29, 30]. Luo et al. anu testatu quattru lncRNA ligatu à u sistema immunitariu è anu custruitu un mudellu predittivu per u risicu di cancheru cervicale [31]. Khan et al. Un totale di 32 trascritti espressi in modu differenziale sò stati identificati, è basatu annantu à questu, hè statu stabilitu un mudellu di predizione cù 5 trascritti significativi, chì hè statu prupostu cum'è un strumentu altamente raccomandatu per predisce u rigettu acutu cunfirmatu da biopsia dopu u trapianto di rene [32].
A maiò parte di sti mudelli sò basati annantu à i livelli d'espressione genica, sia geni chì codificanu proteine ​​sia geni chì ùn codificanu micca. Tuttavia, u listessu genu pò avè valori d'espressione diversi in genomi diversi, furmati di dati è in pazienti diversi, ciò chì porta à stime instabili in i mudelli predittivi. In questu studiu, avemu custruitu un mudellu raghjonevule cù duie coppie di lncRNA, indipendenti da i valori d'espressione esatti.
In questu studiu, avemu identificatu irlncRNA per a prima volta per via di l'analisi di currelazione cù geni ligati à l'immunità. Avemu screening 223 DEirlncRNA per ibridazione cù lncRNA espressi in modu differenziale. Siconda, avemu custruitu una matrice 0-o-1 basata annantu à u metudu di accoppiamentu DEirlncRNA publicatu [31]. Dopu avemu realizatu analisi di regressione univariata è lasso per identificà e coppie di DEirlncRNA prognostiche è custruisce un mudellu di risicu predittivu. Avemu analizatu ulteriormente l'associazione trà i punteggi di risicu è e caratteristiche cliniche in i pazienti cun PAAD. Avemu trovu chì u nostru mudellu di risicu prognosticu, cum'è fattore prognosticu indipendente in i pazienti PAAD, pò differenzià efficacemente i pazienti di altu gradu da i pazienti di bassu gradu è i pazienti di altu gradu da i pazienti di bassu gradu. Inoltre, i valori AUC di a curva ROC di u mudellu di risicu prognosticu eranu 0,905 per a previsione di 1 annu, 0,942 per a previsione di 2 anni è 0,966 per a previsione di 3 anni.
I circadori anu signalatu chì i pazienti cù una più alta infiltrazione di cellule T CD8+ eranu più sensibili à u trattamentu ICI [33]. Un aumentu di u cuntenutu di cellule citotossiche, cellule NK CD56, cellule NK è cellule T CD8+ in u microambiente immune tumorale pò esse una di e ragioni di l'effettu suppressivu di u tumore [34]. Studi precedenti anu dimustratu chì livelli più alti di CD4(+) T è CD8(+) T infiltranti u tumore eranu significativamente assuciati à una sopravvivenza più longa [35]. Una scarsa infiltrazione di cellule T CD8, una bassa carica di neoantigeni è un microambiente tumorale altamente immunosoppressivu portanu à una mancanza di risposta à a terapia ICI [36]. Avemu trovu chì u puntuatu di risicu era correlatu negativamente cù e cellule T CD8+ è e cellule NK, indicendu chì i pazienti cù punteggi di risicu elevati ùn ponu micca esse adatti per u trattamentu ICI è avè una prognosi peghju.
CD161 hè un marcatore di cellule killer naturali (NK). E cellule T CD8+CD161+ CAR-trasdotte medianu una maggiore efficacia antitumorale in vivo in i mudelli di xenotrapianto di adenocarcinoma duttale pancreatico HER2+ [37]. L'inibitori di i checkpoint immunitari miranu à e vie di a proteina 4 associata à i linfociti T citotossici (CTLA-4) è di a proteina 1 di morte cellulare programmata (PD-1)/ligando 1 di morte cellulare programmata (PD-L1) è anu un grande putenziale in parechje aree. L'espressione di CTLA-4 è CD161 (KLRB1) hè più bassa in i gruppi à altu risicu, ciò chì indica ulteriormente chì i pazienti cù punteggi à altu risicu ùn ponu micca esse eligibili per u trattamentu ICI. [38]
Per truvà opzioni di trattamentu adatte per i pazienti à altu risicu, avemu analizatu diversi medicinali anticancerosi è avemu trovu chì paclitaxel, sorafenib è erlotinib, chì sò largamente usati in i pazienti cun PAAD, ponu esse adatti per i pazienti à altu risicu cun PAAD. [33]. Zhang et al anu trovu chì e mutazioni in qualsiasi via di risposta à u dannu di u DNA (DDR) ponu purtà à una prognosi sfavurevule in i pazienti cun cancru di prostata [39]. U studiu Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) hà dimustratu chì u trattamentu di mantenimentu cù olaparib hà prulungatu a sopravvivenza senza progressione paragunata à u placebo dopu a chemioterapia di prima linea à basa di platinu in pazienti cun adenocarcinoma duttale pancreaticu è mutazioni germinali BRCA1/2 [40]. Questu furnisce un ottimisimu significativu chì i risultati di u trattamentu migliuraranu significativamente in questu sottogruppu di pazienti. In questu studiu, u valore IC50 di AZD.2281 (olaparib) era più altu in u gruppu à altu risicu, indicendu chì i pazienti PAAD in u gruppu à altu risicu ponu esse resistenti à u trattamentu cù AZD.2281.
I mudelli di previsione in questu studiu producenu boni risultati di previsione, ma sò basati nantu à previsioni analitiche. Cumu cunfirmà questi risultati cù dati clinichi hè una quistione impurtante. L'ecografia endoscopica per aspirazione cù aghi fini (EUS-FNA) hè diventata un metudu indispensabile per diagnosticà e lesioni pancreatiche solide è extrapancreatiche cù una sensibilità di l'85% è una specificità di u 98% [41]. L'avventu di l'aghi di biopsia cù aghi fini EUS (EUS-FNB) hè principalmente basatu nantu à i vantaghji percepiti rispetto à a FNA, cum'è una maggiore precisione diagnostica, l'ottenimentu di campioni chì preservanu a struttura istologica, è cusì a generazione di tissutu immune chì hè criticu per certe diagnosi. colorazione speciale [42]. Una rivista sistematica di a literatura hà cunfirmatu chì l'aghi FNB (in particulare 22G) dimustranu a più alta efficienza in a raccolta di tissutu da masse pancreatiche [43]. Clinicamente, solu un picculu numeru di pazienti sò eligibili per a chirurgia radicale, è a maiò parte di i pazienti anu tumori inoperabili à u mumentu di a diagnosi iniziale. In a pratica clinica, solu una piccula proporzione di pazienti sò adatti per a chirurgia radicale perchè a maiò parte di i pazienti anu tumori inoperabili à u mumentu di a diagnosi iniziale. Dopu a cunferma patologica da EUS-FNB è altri metudi, di solitu si sceglie un trattamentu non chirurgicu standardizatu cum'è a chemioterapia. U nostru prugramma di ricerca susseguente hè di testà u mudellu prognosticu di questu studiu in coorti chirurgiche è non chirurgiche per mezu di un'analisi retrospettiva.
In generale, u nostru studiu hà stabilitu un novu mudellu di risicu prognosticu basatu annantu à l'irlncRNA accoppiatu, chì hà dimustratu un valore prognosticu promettente in i pazienti cun cancru di u pancreas. U nostru mudellu di risicu prognosticu pò aiutà à diferenzià i pazienti cun PAAD chì sò adatti per u trattamentu medicu.
I datasets utilizati è analizati in u studiu attuale sò dispunibili da l'autore currispundente nantu à dumanda raghjonevule.
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Data di publicazione: 22 settembre 2023